Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRABDQ9H4I3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRABDQ9H4I3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRABDQ9H4I3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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