Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3FQ9H1D9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3FQ9H1D9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3FQ9H1D9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3FQ9H1D9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3FQ9H1D9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms