Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R1Q9GZP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R1Q9GZP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VN1R1Q9GZP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VN1R1Q9GZP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VN1R1Q9GZP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VN1R1Q9GZP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms