Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRY4Q9C004 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRY4Q9C004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRY4Q9C004 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRY4Q9C004 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRY4Q9C004 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRY4Q9C004 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRY4Q9C004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPRY4Q9C004 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRY4Q9C004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms