Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM55Q9BYV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM55Q9BYV6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM55Q9BYV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms