Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK2Q9BVS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK2Q9BVS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK2Q9BVS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK2Q9BVS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK2Q9BVS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms