Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIFC3Q9BVG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIFC3Q9BVG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIFC3Q9BVG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIFC3Q9BVG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIFC3Q9BVG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms