Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM79Q9BSE2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM79Q9BSE2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM79Q9BSE2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms