Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF559Q9BR84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF559Q9BR84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF559Q9BR84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF559Q9BR84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.5 ms