Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USB1Q9BQ65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USB1Q9BQ65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USB1Q9BQ65 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USB1Q9BQ65 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms