Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JSRP1Q96MG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JSRP1Q96MG2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
JSRP1Q96MG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JSRP1Q96MG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms