Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP36Q96G28 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP36Q96G28 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP36Q96G28 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms