Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN9Q8WX39 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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LCN9Q8WX39 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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LCN9Q8WX39 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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LCN9Q8WX39 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCN9Q8WX39 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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LCN9Q8WX39 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN9Q8WX39 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN9Q8WX39 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN9Q8WX39 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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LCN9Q8WX39 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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LCN9Q8WX39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN9Q8WX39 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN9Q8WX39 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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LCN9Q8WX39 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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LCN9Q8WX39 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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LCN9Q8WX39 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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LCN9Q8WX39 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
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LCN9Q8WX39 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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LCN9Q8WX39 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN9Q8WX39 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN9Q8WX39 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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