Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD5Q8TDI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD5Q8TDI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD5Q8TDI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD5Q8TDI0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms