Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDNFQ8TB73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDNFQ8TB73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms