Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT1Q8NF37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPCAT1Q8NF37 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms