Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM1BQ8NB78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM1BQ8NB78 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM1BQ8NB78 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms