Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMIM20Q8N5G0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM20Q8N5G0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM20Q8N5G0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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