Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME8Q8N427 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NME8Q8N427 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NME8Q8N427 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME8Q8N427 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME8Q8N427 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME8Q8N427 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME8Q8N427 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME8Q8N427 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NME8Q8N427 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NME8Q8N427 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NME8Q8N427 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME8Q8N427 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NME8Q8N427 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NME8Q8N427 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME8Q8N427 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NME8Q8N427 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME8Q8N427 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME8Q8N427 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME8Q8N427 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME8Q8N427 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME8Q8N427 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NME8Q8N427 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME8Q8N427 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms