Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D3Q8IZS8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms