Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN12Q8IYM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN12Q8IYM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN12Q8IYM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN12Q8IYM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms