Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD163Q86VB7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD163Q86VB7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD163Q86VB7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms