Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT4Q86UL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT4Q86UL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT4Q86UL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT4Q86UL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms