Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP9Q7RTR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP9Q7RTR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP9Q7RTR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP9Q7RTR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms