Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY3Q7L099 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY3Q7L099 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY3Q7L099 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY3Q7L099 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms