Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM72Q6ZMU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM72Q6ZMU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.2 ms