Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2EQ6VUC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2EQ6VUC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAP2EQ6VUC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms