Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN1Q6UXK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRN1Q6UXK5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN1Q6UXK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN1Q6UXK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN1Q6UXK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRN1Q6UXK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms