Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNIP4Q6PIL6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP4Q6PIL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP4Q6PIL6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms