Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFWD3Q6PCD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFWD3Q6PCD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFWD3Q6PCD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms