Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RCSD1Q6JBY9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCSD1Q6JBY9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCSD1Q6JBY9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms