Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRIP1Q5VSL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRIP1Q5VSL9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
STRIP1Q5VSL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms