Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSPH4AQ5TD94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.66
RSPH4AQ5TD94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RSPH4AQ5TD94 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSPH4AQ5TD94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSPH4AQ5TD94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms