Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPATA46Q5T0L3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPATA46Q5T0L3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPATA46Q5T0L3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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