Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FREM1Q5H8C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FREM1Q5H8C1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM1Q5H8C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM1Q5H8C1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM1Q5H8C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM1Q5H8C1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM1Q5H8C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms