Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SV2CQ496J9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SV2CQ496J9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SV2CQ496J9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SV2CQ496J9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2CQ496J9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms