Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HFEQ30201 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HFEQ30201 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HFEQ30201 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HFEQ30201 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HFEQ30201 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HFEQ30201 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HFEQ30201 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HFEQ30201 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HFEQ30201 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HFEQ30201 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HFEQ30201 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HFEQ30201 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HFEQ30201 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HFEQ30201 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HFEQ30201 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HFEQ30201 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HFEQ30201 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HFEQ30201 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HFEQ30201 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HFEQ30201 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HFEQ30201 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HFEQ30201 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HFEQ30201 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HFEQ30201 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HFEQ30201 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HFEQ30201 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HFEQ30201 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HFEQ30201 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HFEQ30201 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HFEQ30201 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HFEQ30201 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HFEQ30201 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HFEQ30201 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms