Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SIX1Q15475 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIX1Q15475 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX1Q15475 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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