Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBE3CQ15386 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBE3CQ15386 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3CQ15386 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3CQ15386 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3CQ15386 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3CQ15386 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3CQ15386 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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