Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKD1Q15139 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD1Q15139 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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