Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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