Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM39Q14498 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM39Q14498 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM39Q14498 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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