Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF2Q12933 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF2Q12933 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF2Q12933 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF2Q12933 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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