Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	AFG3	YER017C	2286 nt		10.79	□□□□□ -0.68
SMC4	Q12267	RRP9	YPR137W	1722 nt		10.78	□□□□□ -0.68
SMC4	Q12267	DIA4	YHR011W	1341 nt		10.78	□□□□□ -0.68
SMC4	Q12267	PMT1	YDL095W	2454 nt		10.78	□□□□□ -0.68
SMC4	Q12267	PDC5	YLR134W	1692 nt		10.77	□□□□□ -0.68
SMC4	Q12267	MSC3	YLR219W	2187 nt		10.76	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	MED6	YHR058C	888 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	YKL147C	YKL147C	618 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	CDC1	YDR182W	1476 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	PGI1	YBR196C	1665 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	TPI1	YDR050C	747 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	GCG1	YER163C	699 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	YLL056C	YLL056C	897 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	YML018C	YML018C	1182 nt		10.75	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	YNL092W	YNL092W	1203 nt		10.74	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	RPL43A	YPR043W	279 nt		10.74	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	CDC7	YDL017W	1524 nt		10.73	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	LIP5	YOR196C	1245 nt		10.73	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	GPD2	YOL059W	1323 nt		10.71	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	GTS1	YGL181W	1191 nt		10.71	□□□□□ -0.69
SMC4	Q12267	ICP55	YER078C	1536 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YDR327W	YDR327W	327 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YGL102C	YGL102C	429 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	TFG2	YGR005C	1203 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	FMO1	YHR176W	1299 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	PRE3	YJL001W	648 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YKR045C	YKR045C	552 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	ERG27	YLR100W	1044 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YMR295C	YMR295C	594 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	RTC2	YBR147W	891 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YDR187C	YDR187C	519 nt		10.69	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	RNH201	YNL072W	924 nt		10.68	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	TDH2	YJR009C	999 nt		10.67	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YBR113W	YBR113W	483 nt		10.67	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	COQ3	YOL096C	939 nt		10.67	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	DUR3	YHL016C	2208 nt		10.66	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	YMR122C	YMR122C	375 nt		10.66	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	SMX3	YPR182W	261 nt		10.66	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	IRC7	YFR055W	1023 nt		10.65	□□□□□ -0.7
SMC4	Q12267	HPT1	YDR399W	666 nt		10.64	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	MAM3	YOL060C	2121 nt		10.63	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	REC107	YJR021C	945 nt		10.63	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	SNF7	YLR025W	723 nt		10.63	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	TSR2	YLR435W	618 nt		10.62	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	ADH5	YBR145W	1056 nt		10.62	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	HMG2	YLR450W	3138 nt		10.61	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	YBL113C	YBL113C	2379 nt		10.6	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	ERR1	YOR393W	1314 nt		10.6	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	ERR2	YPL281C	1314 nt		10.6	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	HED1	YDR014W-A	489 nt		10.59	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	YAL045C	YAL045C	309 nt		10.59	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	TAE1	YBR261C	699 nt		10.59	□□□□□ -0.71
SMC4	Q12267	THR1	YHR025W	1074 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	PTC7	YHR076W	1032 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	PRI1	YIR008C	1230 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	MEX67	YPL169C	1800 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	RSC9	YML127W	1746 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	OM45	YIL136W	1182 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	FPR3	YML074C	1236 nt		10.58	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	ALD5	YER073W	1563 nt		10.57	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	CUE4	YML101C	354 nt		10.56	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	RPS28A	YOR167C	204 nt		10.56	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	HXK1	YFR053C	1458 nt		10.55	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	CTA1	YDR256C	1548 nt		10.55	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	RUP1	YOR138C	2016 nt		10.55	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	VMA3	YEL027W	483 nt		10.54	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	MET2	YNL277W	1461 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	MHT1	YLL062C	975 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	RPL31B	YLR406C	342 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	SEC62	YPL094C	825 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	MSS51	YLR203C	1311 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	DUS3	YLR401C	2007 nt		10.53	□□□□□ -0.72
SMC4	Q12267	YGL260W	YGL260W	231 nt		10.52	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	YBR027C	YBR027C	333 nt		10.52	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	SPG5	YMR191W	1122 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	ERG8	YMR220W	1356 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	YKL018C-A	YKL018C-A	300 nt		10.5	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	YDL144C	YDL144C	1071 nt		10.5	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	MDH2	YOL126C	1134 nt		10.49	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	YPL102C	YPL102C	303 nt		10.49	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	HIS1	YER055C	894 nt		10.48	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	MSP1	YGR028W	1089 nt		10.48	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	ADE2	YOR128C	1716 nt		10.48	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	RNH1	YMR234W	1047 nt		10.47	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	TCB1	YOR086C	3561 nt		10.46	□□□□□ -0.73
SMC4	Q12267	ZWF1	YNL241C	1518 nt		10.46	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	SGF73	YGL066W	1974 nt		10.45	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	PFS2	YNL317W	1398 nt		10.45	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	HSV2	YGR223C	1347 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YEL034C-A	YEL034C-A	603 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	CUP2	YGL166W	678 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YKL077W	YKL077W	1179 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	DOT1	YDR440W	1749 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		10.43	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YAR064W	YAR064W	300 nt		10.43	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	UIP4	YPL186C	915 nt		10.43	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	YRB2	YIL063C	984 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	VBA5	YKR105C	1749 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SMC4	Q12267	TIF2	YJL138C	1188 nt		10.41	□□□□□ -0.74

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