Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX5Q02548 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAX5Q02548 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX5Q02548 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX5Q02548 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms