Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLCB3Q01970 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCB3Q01970 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PLCB3Q01970 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms