Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFI35P80217 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFI35P80217 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFI35P80217 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFI35P80217 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFI35P80217 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFI35P80217 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFI35P80217 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFI35P80217 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFI35P80217 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFI35P80217 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFI35P80217 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFI35P80217 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFI35P80217 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFI35P80217 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFI35P80217 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFI35P80217 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFI35P80217 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFI35P80217 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFI35P80217 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFI35P80217 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFI35P80217 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFI35P80217 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFI35P80217 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFI35P80217 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFI35P80217 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFI35P80217 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFI35P80217 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFI35P80217 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFI35P80217 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFI35P80217 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFI35P80217 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFI35P80217 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFI35P80217 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFI35P80217 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFI35P80217 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFI35P80217 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFI35P80217 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFI35P80217 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFI35P80217 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFI35P80217 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFI35P80217 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFI35P80217 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFI35P80217 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFI35P80217 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFI35P80217 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFI35P80217 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFI35P80217 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFI35P80217 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFI35P80217 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFI35P80217 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFI35P80217 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFI35P80217 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFI35P80217 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms