Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP6P59044 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NLRP6P59044 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NLRP6P59044 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP6P59044 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NLRP6P59044 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms