Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM33P57088 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM33P57088 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM33P57088 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM33P57088 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM33P57088 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM33P57088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM33P57088 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM33P57088 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM33P57088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM33P57088 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM33P57088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM33P57088 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM33P57088 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM33P57088 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM33P57088 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM33P57088 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM33P57088 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM33P57088 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM33P57088 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.2 ms