Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA1P56199 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA1P56199 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA1P56199 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms