Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXG1P55316 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXG1P55316 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXG1P55316 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXG1P55316 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms